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Los protistas que aparecen más estrechamente relacionados con los animales son los choanoflagellates .
He aquí por qué:
* Similitudes morfológicas: Choanoflagellates comparten similitudes sorprendentes con las células de collar (choanocitos) que se encuentran en las esponjas, los animales más simples. Ambos tienen un solo flagelo rodeado por un collar de microvilli, que se utilizan para filtrar los alimentos del agua.
* Evidencia genética: El análisis molecular, particularmente de los genes de ARN ribosómico, apoya firmemente la estrecha relación evolutiva entre los choanoflagelados y los animales. Comparten un conjunto único de genes que no se encuentran en otros protistas.
* Ancestro potencial: Se cree ampliamente que un antepasado similar a Choanoflagelate dio lugar a los animales.
Si bien se ha sugerido que otros protistas, como los amebozoianos, están estrechamente relacionados con los animales en el pasado, la evidencia apunta abrumadoramente a Choanoflagellates como los parientes vivos más cercanos.