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El salmón respira bajo el agua de la misma manera que respiran otros peces:a través de sus branquias. Las branquias son estructuras plumosas que se encuentran a los lados de la cabeza de un pez. Están compuestos por finos filamentos cubiertos de pequeños vasos sanguíneos. A medida que el agua pasa por las branquias, los vasos sanguíneos absorben oxígeno del agua y liberan dióxido de carbono. Este proceso es similar a cómo los mamíferos respiran aire, excepto que los mamíferos usan sus pulmones para absorber oxígeno y liberar dióxido de carbono.