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La selección natural hace ambas cosas. Como favorece cierto alelo, reduce la variabilidad al causar que los genes con esos alelos se reproduzcan los genes sin.
Por otro lado, dado que ocurre de forma independiente en muchos locus, la selección natural también aumentará la heterocigosidad (o la diversidad de alelos), aumentando así la variación de genes a nivel de especie que a su vez permite a la población adaptarse mejor al envío cambiante.