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No puede determinar de manera confiable el sexo de las águilas calvas en función de las características físicas, como el tamaño o la apariencia, a menos que compare a dos individuos uno al lado del otro:las hembras tienden a ser ligeramente más grandes que los machos. Aparte de eso, tanto las águilas calvas femeninas y machos adultas tienen un tamaño, coloración, marcas y vocalizaciones similares.
Una forma de determinar con precisión el sexo de un águila calva es a través de pruebas genéticas o sexo molecular, lo que implica analizar el ADN del ave para identificar marcadores genéticos específicos que diferencian entre hombres y hembras.