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Las ballenas generalmente no viven en arrecifes de coral. Si bien algunas ballenas pueden ingresar ocasionalmente a las áreas de arrecifes de coral con fines de alimentación o migración, generalmente se encuentran en aguas abiertas de océanos y mares. Los arrecifes de coral son ecosistemas marinos poco profundos habitados principalmente por diversos corales y organismos asociados, y proporcionan hábitats adecuados para muchas especies de peces, invertebrados y plantas marinas asociadas a los arrecifes. Las ballenas, al ser grandes mamíferos marinos, suelen preferir aguas más profundas y, a menudo, realizan movimientos de gran alcance a través de vastas distancias oceánicas. Algunas especies de ballenas, como la ballena jorobada, pueden acercarse a las áreas de arrecifes de coral para actividades de reproducción o alimentación, pero no residen en los arrecifes de coral de forma permanente.