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No se conoce con precisión el tamaño exacto de la población de pingüinos emperador, ya que puede resultar complicado contar con precisión a los individuos en sus vastas y remotas colonias de reproducción. Sin embargo, diversas estimaciones y estudios científicos proporcionan rangos para el tamaño de la población mundial de pingüinos emperador.
Las estimaciones de la población total de pingüinos emperador varían ampliamente. En la década de 1980 y principios de la de 1990, las estimaciones de población oscilaban entre 400.000 y 500.000 parejas reproductoras. Más recientemente, los investigadores han sugerido una estimación de población más alta, que oscila entre aproximadamente 600.000 y 800.000 parejas reproductoras, lo que equivale a alrededor de 1,2 millones a 1,6 millones de pingüinos emperador individuales.
Es importante señalar que estas estimaciones de población se basan en estudios científicos, modelos y análisis de imágenes satelitales, pero sigue siendo difícil obtener cifras precisas para estas remotas poblaciones antárticas. La distribución de las colonias de pingüinos emperador y sus patrones de reproducción, que a menudo ocurren en el hielo marino, dificultan la realización de censos exhaustivos.